В 1996 г. В.Ф. Богданов решил оставить работу, но это никак нельзя было назвать уходом на покой, до 2004 г. мастер продолжал сотрудничать с разными организациями на договорной основе. «Сейчас Василий Федорович на пенсии, живет в г. Нововоронеже, – написали Мария Смольянинова и Н.С. Осипова в журнале «Воронежское подворье» № 2 (24) за 2008 г. – В «заветном» чемодане он хранит дипломы, фотографии, программы. Иногда приезжает в гости к коллегам в Областной центр народного творчества, бескорыстно дарит ценнейшие книги репертуарно-методическому фонду ОЦНТ, за чашкой чая вспоминает командировки, конкурсы, своих учеников… Отдав более полувека хореографии, Богданов и сегодня, находясь на заслуженном отдыхе, проявляет себя как балетмейстер в коллективе Дворца культуры г. Нововоронеж, консультирует коллег по цеху и остается верным Терпсихоре».

Даже уехав из г. Чебоксары, Василий Федорович никогда не терял связи с родным чувашским театром и ставшей очень близкой республикой. С заботой о сохранении истории Чувашского государственного театра оперы и балета Василий Федорович обратился с письмом в Министерство культуры Чувашской Республики, в котором сообщил о своем желании сдать на постоянное хранение в государственный архив документы: личные и о творческой деятельности. «… Думаю, что место моего чувашского архива в Чебоксарах», – писал В.Ф. Богданов.

26-28 июля 2009 г. специалисты Госархива современной истории Чувашской Республики посетили Василия Федоровича Богданова в г. Нововоронеже. Архивисты записали видеоинтервью, оформили сдачу на постоянное хранение в госархив, перевезли документы, фотографии и музейные предметы в г. Чебоксары. Состав поступивших на хранение в госархив документов разнообразный: документы к биографии, творческой деятельности, письма В.Ф. Богданова, собранные архиводержателем, фотографии.

Василий Федорович Богданов скончался 25 сентября 2014 г. в г. Нововоронеже.